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要将小米短信中的所有短信标记为已读，可以按照以下步骤操作。
1、打开短信应用：确保你正在使用小米的短信应用。
2、选择查看短信：查看你的短信列表，这里会显示所有收到的短信。
3、选择标记为已读：短信应用会有一个“全部标记为已读”的选项，这个选项可能在短信列表的顶部或者某个菜单中，例如在右上角可能会看到一个钟形的图标，点击后会出现标记为已读的选择。
4、标记所有短信为已读：点击“全部标记为已读”后，系统会询问你是否确定要这样做，确认后，所有的短信都会被标记为已读。
不同的手机版本或定制的MIUI版本可能会有不同的界面和操作方式，如果上述方法不适用，建议查看小米的官方用户手册或在线帮助资源，以获取更具体的指导，一些第三方短信应用可能也提供类似的功能，但操作方式可能会有所不同。